冬虫夏草冻干可以有效规避传统日晒的弊端
传统的冬虫夏草干制方法一般就是日晒，但是日晒方法干燥冬虫夏草效率偏低，产品含水量很难控制；在日晒的过程中温度不容易控制，如果温度太高，将使冬虫夏草中的热敏性物质发生变性和香味的流失；经过日晒干燥的冬虫夏草体积缩偏小、外形干瘪，而且影响卖相。冻干方式是在低压、低温下使物料脱水干燥，可以有效避免传统日晒中的弊端。
冬虫夏草冻干具体工艺流程步骤如下：
1、清理干净新鲜的冬虫夏草；
2、当冻干箱内的搁物板制冷达到-30℃左右或者是更低的温度，将冬虫夏草摆放在搁板上，持续为搁板进行制冷，使冬虫夏草可以缓慢降温并冻结；
3、冬虫夏草在冻结完成后，需要为搁板制冷转换成为搁物板加热，也就是进行制冷-加热之间的转换，同时开启真空泵维持冻干箱内的低压，使冰升华，直至完成冻干为止。
目前市场上的冻干冬虫夏草主要是低海拔小虫草，以及人工培育冬虫夏草制作而成，相对成本偏低，还有以下这些优势：
冻干虫草颜色相对统一，个头差异比较小，外观更好看。
在失水的过程中，组织结构可能会崩缺，分子中端氨基和端羧基的会受到ph变化影响；在复水后，蛋白质仍然会有20%到50%的失活。至于挥发性物质，冻干后基本上就不存在了；含有低沸点的挥发油成分，这些冻干后会损失，还有一些化学反应活性比较高的生物碱、黄酮类的物质，在失水过程会被破坏。
冻干虫草是低海拔草或者人工培育虫草为主，成本低，利用冻干设备在零下40-60度（虫草的共熔点，也就是固化点温度）让虫草水分冷冻成冰，然后低压真空缓慢升温（也在零度以内）让水分可以直接升华掉。
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